عنوان

جداسازی راه انداز اختصاصی ریشه چغندرقند

‭۲۰۵۱پ‬

per

جداسازی راه انداز اختصاصی ریشه چغندرقند

/زهرا حسن زاده

تبریز: دانشگاه تبریز

‮‭۶۵‬ ص، جدول، نمودار، عکس، لوح فشرده‬

چاپی

واژه نامه بصورت زیرنویس

کتابنامه ص.: ‮‭۶۱-۶۳‬

کارشناسی ارشد

مهندسی کشاورزی- بیوتکنولوژی

‮‭۱۳۸۸/۱۱/۲۵‬

تبریز: دانشگاه تبریز

راه اندازها نقش اساسی در رونویسی و بیان ژنها دارند .تا زمانیکه راه انداز ژن توسط ‮‭RNA‬ پلیمراز مورد شناسایی قرار نگیرد، رونویسی و در نتیجه بیان ژن به وقوع نمی پیوندد .بعضی از ژنها دارای بیان اختصاصی در اندام، بافت و یا شرایط محیطی متفاوت هستند، کلید این بیان اختصاصی در دست راه اندازهای اختصاصی قرار دارد که در اندام، بافت و یا شرایط محیطی خاص فعال می گردند، همین امر ضرورت شناسایی و جداسازی راه اندازهای اختصاصی را نشان می دهد .به دلیل اهمیت چغندرقند به عنوان یک گیاه صنعتی و اقتصادی، این تحقیق روی گیاه مزبور انجام شد .از آنجا که ریشه این گیاه بخش اقتصادی و مورد استفاده آن را تشکیل می‌صدهد شناسایی و جداسازی راه اندازهای اختصاصی آن هدف اصلی این تحقیق می باشد بطوریکه برای تغییر ویژگیهای خاص آن و همچنین پروژه های انتقال ژن مورد استفاده قرارگیرد .در این تحقیق ابتدا اطلاعات مربوط به راه‌صاندازهای اختصاصی ریشه در گیاهان مختلف جمع آوری شده و با راه اندازهای اختصاصی ریشه چغندر از نظر توالی نوکلئوتیدی مورد مقایسه قرار گرفت، سپس با استفاده از قسمتهای مشترک و مورد نظر این راه اندازها، آغازگرهایی طراحی وبرای تولید سفارش داده شد .برای دسترسی به نواحی مورد نظر از ژنوم گیاه چغندرقند، واکنش زنجیره ای پلیمراز با استفاده از آغازگرهای اختصاصی انجام پذیرفت .بدین منظور ابتدا با استفاده از روش‮‭CTAB‬ ، ‮‭DNA‬ گیاه چغندرقند استخراج و به عنوان ‮‭DNA‬الگو در ‮‭PCR‬ مورد استفاده قرار گرفت .بعد از تکثیر قطعات مورد نظر، این قطعات در پلاسمیدصهای ‮‭pBluescript‬ و‮‭Easy - pGEMT‬همسانه سازی شدند .پیرو درج قطعه در پلاسمیدصها از طریق تراریختی باکتریایی، باکتریهای تراریخت تولید و پلاسمیدهای تکثیر یافته در آنها از طریق آنزیمهای برشی مورد تایید قرار گرفته و نهایتا برای تعیین توالی آنها اقدام گردید .در پایان توالیهای حاصله مجددا مورد بررسیهای بیوانفورماتیکی قرار گرفته و نتیجه گیری لازم یعنی شباهت قطعات همسانه سازی شده با اطلاعات موجود در ‮‭NCBI‬ و همچنین عدم وجود تفاوت در نواحی مهم همانند ‮‭UTR‬ مورد تایید قرار گرفت.

Promoters have basic role in gene transcription and expression. Until the promoters aren't recognized by RNA polymerase, transcription and thus gene expression don't occure. Some genes have specific expression in organs, tissues or different environmental conditions. The key to this specific expression is held in specific promoters that activated in organ, tissue or specific environmental conditions. This fact shows the need to identify and isolate specific promoters. Due to the importance of a sugar beet as an industrial and economic plant. This research was done on this plant. Since the roots of this plant form the usable and economic part, the identification and isolation of root specific promoters is main purpose of this research so that, it could be used for specific characters and gene transfer project as well. In this work first, the nucleotide sequence of different root specific promoters were collected and compared with root specific promoters of sugar beet, and then based on desired and common parts, the specific primers were designed and ordered for synthesis. To acces this parts from sugar beet plant genome, polymerase chain reaction was carried out using specific primers. On this purpose, first genomic DNA of sugar beet plant was extracted by CTAB method and used as a DNA template in PCR. After amplification of the fragments, they were cloned in PGEMT- Easy and pBluescript vectors. following the insertion of fragments within plasmids, bacterial transformant were produced by transformation and resulted plasmids were confirmed using restriction digestion and finally they were sent for sequencing. At the end resulted sequences were studied again thiough bioinformatic softwares and required conclusion were taken place..

Isolation

Root Specific promoter

Sugar beet

حسن زاده، زهرا

باغبان کهنه روز، بهرام، استاد راهنما

قلی زاده، اشرف، استاد مشاور

سیاه و سفید

نمایه‌سازی قبلی