تنوع ژنتیکی ژنوتیپهای جو با استفاده از نشانگرهایSSR
First Statement of Responsibility
/همایون دادبه
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
: دانشکده کشاورزی
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۶۵ص
NOTES PERTAINING TO PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC.
Text of Note
چاپی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
رشته اصلاح نباتات
Date of degree
۱۳۹۲/۰۵/۱۲
Body granting the degree
تبریز
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
به منظور بررسی تنوع و ساختار ژنتیکی ۷۰ ژنوتیپ بومی، رقم تجاری و لاین اصلاحی جو، ۱۰۰ جفت آغازگر ریزماهواره مورد استفاده قرار گرفت .با استفاده از ۷۱ جفت آغازگر چندشکل، ۲۹۰ آلل با دامنه ۲ تا ۱۵ و میانگین ۰۸/۴ آلل به ازای هر جایگاه ریزماهواره در ژنوتیپهای مورد بررسی تکثیر گردید .میانگین تنوع ژنی، میزان اطلاعات چندشکلی (PIC) و فراوانی آلل شایع به ترتیب۴۲/۰ ، ۳۸/۰ و ۶۸/۰ محاسبه گردید .برای تجزیه واریانس مولکولی ژنوتیپهای مورد مطالعه به دو گروه لاینهای بومی و ارقام تجاری به همراه لاینهای پیشرفته اصلاحی تقسیم شدند .نتایج نشان دهنده وجود تنوع ژنتیکی قابل قبول در بین دو گروه مورد مطالعه بود .همچنین سهم بیشتر واریانس درونگروهی (۸۸) در تبیین واریانس مولکولی کل بیانگر تنوع ژنتیکی بالا در درون گروههای تفکیک شده بود .واریانس مولکولی درونگروهها تفاوت زیادی با یکدیگر نداشت و مقادیر برای ژنوتیپهای بومی و لاینهای تجاری-اصلاحی به ترتیب برابر با ۴۷/۲۸ و ۹۹/۲۹ بود .شاخص تنوع ژنی نی و شاخص اطلاعات شانون برای گروه لاینهای بومی به ترتیب ۴/۰ و ۷۵/۰ و برای گروه لاینهای تجاری ۳۹/۰ و ۷/۰ برآورد شد که مبین وجود تنوع ژنتیکی قابل قبول در هر دو گروه میباشد .در تجزیه به بردارهای اصلی سه بردار اول در مجموع ۵۷/۷۶ درصد از کل واریانس مولکولی بین ژنوتیپها را تبیین کردند .نمودار پراکنش حاصل از دو بردار اول نشان دهنده پراکنش بالای افراد در درون و تفکیک نسبی گروههای مذکور بود که در کل وجود تنوع ژنتیکی قابل قبول در بین ژنوتیپهای مورد آزمایش را نیز تأیید کرد .تجزیه خوشهای با استفاده از الگوریتم Minimum Evolution و ضریب فاصلهCantor - Jukesانجام شد .بر این اساس ژنوتیپهای مورد مطالعه به سه گروه اصلی و دو زیرگروه در داخل یکی از گروهها تقسیم شدند .به طور کلی بر اساس نتایج بررسیهای مولکولی تنوع ژنتیکی قابل ملاحظهای بین ژنوتیپهای مورد مطالعه مشاهده شد که از این تنوع میتوان در برنامههای اصلاحی به منظور گزینش و تولید لاینهای برتر استفاده کرد
Text of Note
Cantor distance coefficient assigned the genotypes into three groups and within a group. In conclusion based on the molecular data analysis, substantial amount of genetic diversity was observed among the barley genotypes under study which can be utilized in breeding programs for selecting and producing superior barley lines-In order to estimate the level of genetic diversity of 70 barley genotypes, commercial varieties and improved breeding lines, 100 microsatellite primers were employed. Seventy one primers amplified 290 alleles with the range of 2 to 15 and an average of 4.08 alleles per locus. The mean gene diversity, polymorphic information content (PIC) and frequency of major allele were 0.42, 0.38 and 0.68, respectively. Analysis of molecular variance based on separating genotypes into two groups (landraces vs. commercial varieties and improved lines) indicated a acceptable genetic diversity between these groups. Furthermore, larger proportion of within group variation ( 88) of the total molecular variance determined the presence of high genetic variation within the groups. However within group variations almost similar were (28.47 and 29.99) for landraces and commercial varieties, respectively. Nei's gene diversity index and Shannon's index were 0.4 and 0.75 for group and 0.39 and 0.7 for commercial and improved lines, respectively, indicating the existence of reliable genetic diversity within both groups. In the principal coordinates analysis the first three coordinates explained about 76.57 of the total molecular variance. The scatter plot based on two first coordinates indicated large variation within and relative separation between two groups which confirmed the presence of high genetic diversity under study. Cluster analysis based on Minimum Evolution algorithm and Jukes