NOTES PERTAINING TO PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC.
Text of Note
چاپی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
علوم جانوری - ژنتیک مولکولی
Date of degree
۱۳۹۲/۱۱/۲۵
Body granting the degree
تبریز
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
مقدمه :سرطان معده معمول ترین سرطان دستگاه گوارش و چهارمین سرطان شایع دنیا بوده بعد از سرطان ریه دومین سرطان کشنده در جهان بشمار میرود .این در حالیست که شیوع سرطان معده در مردان و در کشورهای در حال توسعه بیشتر می باشد و در کشورمان ایران نیز رتبه دوم سرطان در مردان را به خود اختصاص داده استmicroRNA .ها RNA های کوچک دو رشته ای بطول ۱۸ تا ۲۴ نوکلئوتید هستند که در امر تنظیم بعد از رونویسی در یوکاریوتها نقش داشته از طریق مکمل شدن با mRNA هدف در ۳'UTR باعث برش در آن و تجزیه mRNA میگردند .تغییر در سطوح miRNA در شرایط مختلف پاتولوژیکی بویژه سرطان مشاهده شده است .در سالهای اخیر مطالعه روی miRNA ها و نقش آنها در ایجاد و پیشرفت سرطان های مختلف بطور گسترده انجام گرفته و نتایج جالبی به همراه داشته است .نقش انکوژنیmicroRNA های۳۷۳ - miRو۵۲۰c - miRدر رده سلولهای سرطان سینه، مهاجرت سلولهای fibrosarcoma و نیز تومور لایه زاینده بیضه مشخص شده است .در این مطالعه هدف بررسی نقش احتمالی اینmicroRNA ها در ایجاد آدنوکارسینومای معده از طریق سنجش و مقایسه میزان بیان آنها در تومور آدنوکارسینومای معده و بافت سالم حاشیه تومور می باشد که تواناییmicrRNA های۳۷۳ - miRو۵۲۰c - miRرا به عنوان مارکرهای تشخیصی در آدنوکارسینومای معده را بررسی خواهد کرد .همچنین تعیین قابلیت اینmiRNA ها به عنوان اهداف تحقیقات درمانی در درمان سرطان معده از نتایج دیگر این مطالعه خواهد بود .مواد و روشها :جمعا ۴۱ "بافت توموری و بافت نرمال حاشیه تومور از بیمارستان های شهید مدنی و امام رضا تبریز جمع آوری شد .نمونه ها بعد از آندوسکوپی بلافاصله درون ازت مایع به فریزر دمای۸۰- منتقل شدند .استخراج RNA کل توسط ماده TRIzol طبق پروتوکل انجام گرفته بعد از تعیین غلظت و خلوص RNA استخراج شده مراحل تیمار RNA با آنزیمDNase I ، اضافه نمودن دم پلی A توسط آنزیمtransferase - Poly Aو تهیه cDNA با استفاده از پرایمرهای اختصاصی برای۵۲۰c - miRو miR۳۷۳ انجام گرفت .سنجش بیانRNA - microهای فوق توسط تکنیکTime PCR - Realبا ماده SYBER Green و با استفاده از U۶ به عنوان کنترل داخلی انجام شده و Ct های حاصله مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند .نتیجه گیری و بحث :به علت set up نشدن واکنشTime PCR - Realبرای۳۷۳ - miRو عدم حصول نتایج صحیح کافی، از ادامه کار با این microRNA صرفنظر شد .نتایج کمی بدست آمده از بررسی بیان۵۲۰c - miRتوسط نرم افزارهای REST و SPSS حاکی از عدم تغییر معنی دار آن در آدنوکارسینومای معده بود .همچنین ارتباط معنی داری بین بیان۵۲۰c - miRو ویژگی های کلینیکوپاتولوژیکی بیماران یافت نشد .لذا، گرچه تغییر بیان۵۲۰c - miRدر برخی سرطان ها گزارش شده است، ولی این microRNA مارکر مناسبی برای تشخیص آدنوکارسینومای معده نمی باشد
Text of Note
Introduction: Gastric cancer is the most common cancer of digestive tract and the fourth prevalent cancer worldwide. As the most lethal global malignant neoplasm after lung cancer, gastric adenocarcinoma is gaining more break-out among men especially in developing countries. However, this malignancy has hit second rank among Iranian men.MicroRNAs are small single-stranded, non-coding RNAs ranging 18 to 24 nucleotides in length and participate in post-translational gene regulation in eukaryotes via base pairing to their target's 3' untranslated region that results in incision and finally degradation of their target mRNAs. Differential expression of microRNAs have been shown in pathological conditions involving cancer. In recent years, microRNA studies to find out their roles in cancer development have unveiled their contribution to all sorts of cellular functions.Studies have demonstrated miR-373 and miR-520c as oncogenes in breast cancer cell lines, fibrosarcoma cells migration and testicular progenitor cells tumor. This study analyses probable role of miR-373 and miR-520c in development of gastric adenocarcinoma by evaluation of their differential expression to investigate their potential as diagnostic marker in gastric adenocarcinoma. Their potency as further therapeutic target in gastric cancer would be of desire too.Materials and methods: Forty one gastric adenocarcinoma samples and corresponding normal marginal tissues were collected from Tabriz Shahid Madani and Imam Reza hospitals. Samples were snap frozen in liquid nitrogen after endoscopy by specialist and transferred to -80?c frizzier. Total RNA was extracted using TRIzol reagent according to product protocol. Concentration and purity was measured before treatment with DNase I enzyme. Poly-A tail was added to treated RNA using Poly-A transferase enzyme and then RT-PCR was carried out using specific primers for miR-373, miR-520c and U6 as internal control to generate corresponding cDNA. RT products were subjected to Real-Time PCR reaction in duplicate using SYBER Green Real-Time Master Mix. U6 was used as internal control. Obtained Ct values for reactions were normalized for variations in the amount of RNA between different samples.Results and Conclusion: Due to unreliable Ct values resulted from miR-373 quantification, this microRNA was dismissed from further analysis. Obtained results from miR-520c expression analysis by REST and SPSS softwares showed no meaningful expression variation in gastric adenocarcinoma. Also there was no significant correlation between miR-520c expression and patients' clinicopathological features. Although miR-520c differential expression have been reported in some types of cancers, this study proved it's insufficiency as suitable prognostic marker in gastric adenocarcinoma