NATIONAL BIBLIOGRAPHY NUMBER
Number
T27579
LANGUAGE OF THE ITEM
.Language of Text, Soundtrack etc
انگلیسی
TITLE AND STATEMENT OF RESPONSIBILITY
Title Proper
Transcriptome profiling of HCT116 colorectal cancer cell line before and after treatment with Nano Curcumin
General Material Designation
Dissertation
First Statement of Responsibility
Hewa Jalal Azeez
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
Natural sciences
Date of Publication, Distribution, etc.
1401
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
103p.
Other Physical Details
cd
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
Ph.D.
Discipline of degree
Molecular Genetics
Date of degree
1401/08/08
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
Colorectal cancer (CRC) is the third most common cancer diagnosed in males and the second most common malignancy in females. Anti-cancer compounds such as curcumin derived from various natural medicines have been well studied for their ability to prevent or even reverse early-stage cancer progression through their potent anti-proliferation and anti-oxidant activities. Turmeric (Curcuma longa) is a popular Indian spice that has been used for centuries in herbal medicines for treatment. Curcumin is a potent antitumor compound that has been shown to influence multiple gene targets in various cancer-related pathways, inhibit cancer cell proliferation, and induce cancer cell death. Here, we aimed to uncover the possible novel targets of gemini curcumin (Gemini-Cur) on colorectal cancer and related cellular pathways. After confirming the cytotoxic effect of Gemini-Cur by MTT and apoptotic assays, RNA sequencing was employed to monitor differentially expressed genes (DEGs) in HCT-116 cells. On a total of 3892 DEGs (padj <0.01), 244 genes showed up-regulation and 198 genes revealed down-regulation. Gene ontology (GO) enrichment analysis was done, and then PPI and gene-pathway networks were constructed using STRING and Cytoscape. The pathway analysis illustrated that Gemini-Cur modulates cell cycle-dependent pathways predominantly. From the list of top DEGs, five genes corresponding to the GADD45G and ATF3 (up-regulated) and BUB1B, CCNA2 and CDK1 (down-regulated) were selected for further studies. Real-time qPCR and western blotting confirmed the significant modulation of the expression of these genes in Gemini-Cur treated cells compared to non-treated cells. In conclusion, our RNA sequencing revealed novel potential targets of curcumin on cancer cells that demand further studies to understand the related molecular mechanisms.
Text of Note
سرطان روده بزرگ سومین سرطان شایع مردان و دومین بدخیمی در زنان می باشد. توانائی مهار و حتی برگرداندن رشد سرطان از طریق فعالیت های ضد تکثیری و ضد اکسیدانی برای عوامل ضدسرطان مستخرج از ترکیبات طبیعی مثل کروکومین به خوبی مطاله شده است. زردچوبه یک ادویه هندی شناخته شده است که مدت ها برای درمان در حوزه گیاهان داروئی استفاده شده است. کورکومین یک ترکیب موثر ضدسرطان می باشد که اهداف مختلف ژنی را در مسیرهای مرتبط با سرطان متاثر ساخته، رشد سلولی را مهار نموده و باعث القای مرگ سلولی می شود. اینجا، ما درصدد مشخص نمودن اهداف ژنی جدید برای جمینی کورکومین و مسیرهای مرتبط سلولی در سرطان روده بزرگ برآمدیم. بعد از تایید سمیت سلولی با آزمایشهای MTT و مرگ سلولی، توالی یابی RNA برای آشکارسازی ژنهای با بیان متمایز (DEGs) در سلول های HCT116 به کار گرفته شد. از حدود 3892 ژن DEG، حدود 244 ژن بیان با بیان بالا و 198 مورد کاهش بیان داشتند. اونتولوژی ژنی مورد بررسی قرار گرفته و سپس، شبکه PPI و مسیر Gene-Pathway توسط برنامه های STRING و Cytoscape ایجاد گردید. آنالیز مسیرها نشان داد که Gemini-Cur اغلب مسیرهای مرتبط با چرخه سلولی را مختل می کند. از بین ژنهای با بیان بالا، 5 ژن شامل GADD45G و ATF3 (بیش بیان) و BUB1B، CCNA2 و CDK1 (کاهش بیان) برای آنالیز بیشتر انتخاب شدند. روش Real-time PCR و western blotting تغییر معنی دار این ژنها را در سلولهای تیمار شده با Gemini-Cur نسبت به غیرتیمار شده ها تایید کردند. در مجموع، توالی یابی RNA ما اهداف ژنی جدیدی را برای Gemini-Cur مشخص نمود که مطالعات زیادی را برای مشخص کردن مکانیسم های مولکولی مرتبط طلب می نماید
OTHER VARIANT TITLES
Variant Title
مطالعه پروفایل ترانسکریپتوم سلولی سرطانی کلورکتالHTC-116 قبل و بعد از تیماری نانوکورکومین
UNCONTROLLED SUBJECT TERMS
Subject Term
Gemini curcumin, HCT116 cell line, Transcriptome, RNA sequencing, Gene ontology, Western blotting
Subject Term
جمینی کورکومین، سلول HCT116، ترانسکریپتوم، توالی یابی RNA، Gene Ontology، وسترن بلاتینگ
PERSONAL NAME - PRIMARY RESPONSIBILITY
Entry Element
Jalal Azeez,
Part of Name Other than Entry Element
Hewa
Relator Code
Producer
PERSONAL NAME - SECONDARY RESPONSIBILITY
Entry Element
Babaei,
Entry Element
Hosseinpour Feizi,
Entry Element
Neri,
Part of Name Other than Entry Element
Esmaeil
Part of Name Other than Entry Element
Mohammad Ali
Part of Name Other than Entry Element
Francesco
Relator Code
Thesis advisor
Relator Code
Consulting advisor
Relator Code
Consulting advisor
CORPORATE BODY NAME - SECONDARY RESPONSIBILITY
Entry Element
Tabriz
ORIGINATING SOURCE
Country
ایران
Agency
Central Library of Tabriz University
Date of Transaction
20221114
LOCATION AND CALL NUMBER
Call Number
دکتری پایاننامه QL351.J3 1401
ELECTRONIC LOCATION AND ACCESS
Electronic name
Hewa Jalal Azeez
Contact for access assistance
عبادی
e
TL
276903
a
Y
