طراحی روش شناسایی هفت تیپ پرخطر سرطانزایی (۱۶، ۱۳، ۳۳، ۳۵، ۵۲، ۵۸، ۶۷) از ویروس HPV با روش مبتنی بر توالی
عنوان اصلي به زبان ديگر
Designing a method for identifying seven high-risk carcinogenicity types (۱۶, ۳۱, ۳۳, ۳۵, ۵۲, ۵۸, ۶۷) from viruses HPV using sequence method
نام نخستين پديدآور
/آرزو علیمردانی
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
: علوم طبیعی
تاریخ نشرو بخش و غیره
، ۱۳۹۸
نام توليد کننده
، عباسپور
یادداشتهای مربوط به نشر، بخش و غیره
متن يادداشت
چاپی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
کارشناسی ارشد
نظم درجات
ژنتیک
زمان اعطا مدرک
۱۳۹۸/۰۶/۱۶
کسي که مدرک را اعطا کرده
تبریز
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
پاپیلوماویروس انسانی یا HPV دارای بیش از ۲۰۰ تیپ هست که برخی میزان سرطانزایی بالایی دارند .برای کاهش میزان مرگومیر ناشی از سرطان رحم نیاز به غربالگری هست که میزان حساسیت و اختصاصیت برای شناسایی تیپها نتایج مناسبی نداشته است .حساسیت PCR وابسته به پرایمرهاست که در این پژوهش از PCR با طراحی پرایمرهای مختص تیپ، برای شناسایی و تمایز نسبی ۷ تیپ پرخطر و نیز تیپهای دیگر در نمونه با عفونت چندگانه با تغییر دمای annealing و اختصاصیت بیشتر با توالی یابی سنگر استفاده شد .نمونهی ۲۲ با تیپهای ۱۶، ۳۱ و ۴۵ تأییدشده با کیت هیبریداسیون دات بلات، در این پژوهش مشخص شد که نمونه ۲۲ فاقد تیپ ۱۶ ولی دارای تیپ ۵۲ هست .با توالی یابی سنگر مشخص شد که نمونهی ۴ فاقد تیپ ۶ اما دارای تیپ ۴۰ و ۶۸ و نمونهی ۶ نیز فاقد تیپ ۶ اما دارای تیپ ۵۲ و ۸۹ هست که در هیبریداسیون بهاشتباه تشخیص دادهشده است .پرایمرهای طراحی شده در ترکیب با هم نیز میتوانند تیپهای مختلفی را تکثیر و نیز تمایز نسبی بر قرار کنند که در دو نمونهی ۴ و ۲۷ با تیپ ۵۲ تیپ ۵۲ توسط پرایمر های مختلف شناسایی شد و با توالی یابی تأیید گردید .پرایمر دژنره ای نیز طراحی شد که میتواند انواع تیپها را با PCR تکثیر دهد که در نمونههای پاپ اسمیر منجر به دیدن باند شد .مشخص شد که روش PCR به همراه توالی یابی سنگر با پرایمرهای طراحیشده دارای حساسیت و اختصاصیت بیشتر نسبت به هیبریداسیون دات بلات است
متن يادداشت
Human papillomavirus, or HPV, has more than 200 types, some of which are highly carcinogenic. To reduce the mortality rate from uterine cancer, screening is required, which has not been shown to be sensitive and specific for identifying types. The sensitivity of PCR depends on the primers. In this study, PCR was used to design and differentiate 7 high-risk types and other types in the sample with multiple infection by changing the annealing temperature and more specificity with sanger sequencing. Sample 22 with types 16, 31 and 45 approved with dot blot hybridization kit, in this study, it was found that sample 22 does not have type 16 but has type 52. By sanger sequencing, it was found that sample 4 did not have type 6 but had type 40 and 68 and sample 6 also did not have type 6 but had type 52 and 89 which was detected incorrectly in hybridization. Primers designed in combination can also amplify different types and establish relative differentiation, which was identified by different primers in samples 4 and 27 with type 52 and type 52 and was confirmed by sequencing. A degenerative primer was also designed that could amplify a variety of types by PCR, which resulted in band smear sampling. It was found that PCR method with sanger sequencing with designed primers has more sensitivity and specificity than dot blot hybridization
عنوان اصلی به زبان دیگر
عنوان اصلي به زبان ديگر
Designing a method for identifying seven high-risk carcinogenicity types (۱۶, ۳۱, ۳۳, ۳۵, ۵۲, ۵۸, ۶۷) from viruses HPV using sequence method
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )