بررسی بیان RNA های بلند غیر کدکننده ی MCM3AP-AS1 , HNF1A-AS1 در بیماران مبتلا به سرطان روده بزرگ و تاثیر شیمی درمانی بر بیان این ژن ها
نام نخستين پديدآور
آی ناز اصغروند حاجب
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
علوم طبیعی
تاریخ نشرو بخش و غیره
۱۴۰۲
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
۱۱۳ص.
مواد همراه اثر
سی دی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
کارشناسی ارشد
نظم درجات
ژنتیک
زمان اعطا مدرک
۱۴۰۲/۰۶/۲۸
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
سرطان کلورکتال (CRC) یک تومور بدخیم شایع در دستگاه گوارش است که از نظر بروز در رتبه سوم و از نظر مرگ و میر در رتبه دوم قرار دارد . مطالعات اخیر گزارش داده اند که lncRNA ها با وجود پتانسیل غیر کدگذاری در بسیاری از بیماری ها از جمله سرطان نقش دارند. lncRNA های مختلف به عنوان تعدیل کننده سرطان زایی و پیشرفت در CRC انسان عمل می کنند . lncRNA MCM3AP-AS1 ،lncRNA HNF1A-AS1 در سرطان های مختلفی مورد مطالعه قرار گرفتند . هدف از مطالعه ی حاضر بررسی بیان ژن هایlncRNA MCM3AP-AS1 ،lncRNA HNF1A-AS1 در بیماران مبتلا به سرطان روده بزرگ قبل و بعد شیمی درمانی با افراد کنترل بود . علاوه براین میزان بیان این ژنها در بین مردان و زنان ، دو گروه سنی ، محل تومور ، بافت شناسی تومور ، تمایز تومور ، مرحله TNM ، درگیری غدد لنفاوی و عفونت ناشی از هلیکوباکترپیلورری مورد مطالعه قرار گرفت . برای این منظور نمونه بافتی از 98 بیمار مبتلا به سرطان روده بزرگ قبل و بعد شیمی درمانی و 71 نمونه از افراد کنترل از مرکز تحقیقات دانشگاه علوم پزشکی تهران جمع اوری شد . با استفاده از معرف ترایزول RNA های نمونه ها استخراج شد و پس از سنتز cDNA آزمایش Real-timePCR برای بررسی بیان ژن ها انجام گرفت . داده ها ی حاصل با استفاده از نرم افزارهای SPSS وGraphPad آنالیز شدند. نتایج حاصل از آنالیز lncRNA HNF1A-AS1 بین افراد قبل درمان با افراد کنترل معنی دار بود که نشان دهنده ی افزایش بیان lncRNA HNF1A-AS1در افراد بیمار قبل از درمان نسبت به افراد کنترل بود. با وجود این در مقایسه میزان بیان ژن lncRNA HNF1A-AS1بین افراد بعد درمان با افراد کنترل ، افراد قبل و بعد درمان ، بین دو گروه سنی بالای 55 سال و پایین 55 سال ، بین مردان و زنان ، بین محل تومور ، بین بافت شناسی تومور ، بین مرحله TNM ، درگیری غدد لنفاوی ، عفونت ناشی از هلیکوباکترپیلورری اختلاف معنی دار مشاهده نشد . اما بین تمایز تومور اختلاف معنی دار مشاهده شد .lncRNA HNF1A-AS1 براساس نتایج حاصل از منحنی ROC به عنوان بیومارکر تشخیصی ضعیف (AUC:0/62) می توان معرفی کرد ولی به عنوان بیومارکر پیش اگهی (AUC:0/55) نمی توان معرفی کرد . نتایج حاصل از آنالیز lncRNA MCM3AP-AS1 بین افراد قبل از درمان با افراد کنترل معنا دار بود که نشان دهنده ی افزایش بیان lncRNA MCM3AP-AS1 در افراد مبتلا به سرطان روده بزرگ قبل درمان نسبت به افراد کنترل بود . همچنین در مقایسه میزان بیان ژن lncRNA MCM3AP-AS1بین افراد بعد درمان با افراد کنترل ، افراد قبل و بعد درمان ، بین دو گروه سنی بالای 55 سال و پایین 55 سال ، بین مردان و زنان ، بین محل تومور ، بین بافت شناسی تومور ، بین مرحله TNM ، درگیری غدد لنفاوی ، عفونت ناشی از هلیکوباکترپیلورری و بین تمایز تومور اختلاف معنی دار مشاهده نشد.نتایج حاصل از منحنی ROC برای lncRNA MCM3AP-AS1نیز نشان داد که به عنوان بیومارکر تشخیصی (AUC:0/59) و بیوماکر پیش آگهی (AUC:0/54) نمی توان معرفی کرد . همچنین ترکیب lncRNA MCM3AP-AS1 ،lncRNA HNF1A-AS1 را میتوان به عنوان بیومارکر تشخیصی ضعیف (AUC:0/66)معرفی کرد ولی به عنوان بیومارکر پیش آگهی(AUC: 0/58) نمی توان معرفی کرد .
متن يادداشت
Abstract : Colorectal cancer (CRC) is a common malignant tumor in the digestive system, which ranks third in terms of incidence and second in terms of mortality. Recent studies have reported that lncRNAs are involved in many diseases, including cancer, despite their non-coding potential. Different lncRNAs act as moderators of carcinogenesis and progression in human CRC. lncRNA MCM3AP-AS1, lncRNA HNF1A-AS1 were studied in various cancers. The aim of the present study is to investigate the expression of genes lncRNA MCM3AP-AS1, lncRNA HNF1A-AS1 in colorectal cancer patients before and after chemotherapy were compared with control people. In addition, the expression level of these genes among men and women,Two age groups ، Tumorsite ، Tumorhistology ، Tuumoor differentiation ، TNM stage ، Involvement of lymph nodes and Helicobacter pylori infection was studied. For this purpose, tissue samples from 98 patients with colorectal cancer before and after chemotherapy and 71 samples from control people were collected from the Research Center of Tehran University of Medical Sciences. RNAs of the samples were extracted using Trizol reagent and after cDNA synthesis, Real-time PCR test was performed to check gene expression. The resulting data were analyzed using SPSS and GraphPad software. The results of lncRNAHNF1A-AS1 analysis were significant between pre-treatment people and control people, which indicated an increase in lncRNAHNF1A-AS1 expression in patients before treatment compared to control people. However, there was not significant difference in expression of this gene between people after treatment and control people, people before and after treatment, between two age groups above 55 years and below 55 years, between men and women, between Tumorsite, between Tumorhistology, between TNM stage, lymph node involvement, Helicobacter pylori infection . But a significant difference was observed between Tuumoor differentiation. According to the results of the ROC curve, lncRNA HNF1A-AS1 can be introduced as a weak diagnostic biomarker (AUC:0/62), but it cannot be introduced as a prognostic biomarker (AUC:0/55). The results of lncRNAMCM3AP-AS1 analysis between patients before treatment with control people were significant , which indicated an increase in the expression of lncRNA MCM3AP-AS1 in people with colorectal cancer before treatment compared to control people. Also, there was not significant difference in expression of this gene between people after treatment and control people, people before and after treatment, between two age groups above 55 years and below 55 years, between men and women, between Tumorsite, between Tumorhistology, between TNM stage, lymph node involvement, Helicobacter pylori infection and Tuumoor differentiation. The results of the ROC curve for lncRNA MCM3AP-AS1 also showed that it cannot be introduced as a diagnostic (AUC0/59) or prognostic (AUC:0/54) biomarker. Also, the combination of lncRNA MCM3AP-AS1 and lncRNA HNF1A-AS1 can be introduced as a weak diagnostic biomarker (AUC:0/66), but cannot be introduced as a prognostic biomarker (AUC:0/58).
عنوانهای گونه گون دیگر
عنوان گونه گون
Investigating the expression of long non-coding RNAs HNF1A-AS1, MCM3AP-AS1 in patients with colorectal cancer and chemotherapy influence on the expression of these genes
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )