بررسی تغییرات بیان miRNA ها در نمونه های بافت و خلط افراد ایرانی مبتلا به سرطان ریه نوع NSCLC
نام عام مواد
[پایاننامه]
عنوان اصلي به زبان ديگر
Evaluation of changes in miRNA expression in tissue and sputum samples of Iranian patients with NSCLC
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation Sciences))
تاریخ نشرو بخش و غیره
، ۱۳۹۵
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
ز،۱۴۳ص.
یادداشتهای مربوط به نشر، بخش و غیره
متن يادداشت
چاپی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
دکترا
نظم درجات
ژنتیک پزشکی Medical Genetics
زمان اعطا مدرک
۱۳۹۵/۱۱/۱۷
کسي که مدرک را اعطا کرده
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation Sciences))
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
Nonsmall cell lung cancer (NSCLC) به عنوان کشنده ترین نوع سرطان در جهان شناخته شده است اما تشخیص زود هنگام این سرطان نتیجه را بسیار تغییر خواهد داد .تشخیص زود هنگام NSCLC بدلیل نبود مارکرهای اختصاصی و در عین حال غیر تهاجمی با مشکل مواجه شده است microRNA (miRNA) .ها نقش مهمی را در شروع و پیشرفت NSCLC بازی می کنند .در این پروژه ما بدنبال مجموعه ای از miRNA ها مخصوصا در خلط برای تشخیص زود هنگام NSCLC می باشیم .استخراج RNA از بافت و خلط 10 فرد مبتلا به NSCLC و 10 کنترل انجام شد و مخلوط RNA های گروه مبتلا به سرطان و گروه کنترل small RNA seq شدند .نتایج توالی یابی آنالیز و miRNA های متمایز در تمام افراد گروه مبتلا به سرطان و گروه کنترل توسطPCR - real time RTمورد ارزیابی قرار گرفتند .در نمونه های خلط افراد مبتلا به NSCLC در مقایسه با گروه کنترل223 - miRو31 - miRافزایش بیان،15a- miR،100 - miRو194 - miRکاهش بیان معنی داری داشتند .در نمونه های بافت افراد مبتلا به NSCLC در مقایسه با گروه کنترل223- miR،1307 - miRو31 - miRافزایش بیان،15a- miR،205 - miRو194 - miRکاهش بیان معنی داری داشتند .بهترین نتیجه متعلق به مجموعه ای از15a- miR،100 - miRو194 - miRبود که با حساسیت 3/93 و ویژگی 100 و AUC ای برابر با 97/0 نمونه های خلط مبتلا به سرطان را از گروه کنترل متمایز می کرد .علاوه بر پایداری بسیار خوب miRNA ها نسبت به شرایط مختلف، بدلیل قدرت تنظیمی و اثری که بر روی RNA های کد کننده و غیر کد کننده پروتئین دارند به عنوان بیومارکرهایی مفید مطرح شده اند .تغییرات بیان این بیومارکرها در نمونه های غیر تهاجمی خلط افراد مبتلا به سرطان در مقایسه با گروه کنترل مسیر جدیدی را برای تشخیص NSCLC پیش روی ما قرار داده است .کلید واژه هاNSCLC :، بیومارکر،15a- miR،100 - miRو194 - miR
متن يادداشت
Nonsmall cell lung cancer (NSCLC) is the leading cause of cancer death. Early detection of NSCLC who would benefit most from effective therapies will improve its outcome. Diagnosis of NSCLC at an early stage has a daunting challenge due to the deficiency of specific noninvasive markers. Analysis of molecular genetic biomarkers specially in biological fluids has been proposed as a useful tool for cancer diagnosis. MicroRNAs (miRNAs) play important roles in the initiation and progression of NSCLC. Here, we aimed to develop a panel of miRNAs specially in sputum for NSCLC early detection. Total RNA of pooled 10 tissue and sputum of NSCLC patients and 10 tissue and sputum of matched control group sent for small RNA sequencing. Result were analyzed and significant miRNAs were examined by quantitative real time RT-PCR assay in all of the tissue and sputum samples. MiR-223 and miR-31 were upregulated and miR-15a, miR-100 and miR-194 were downregulated in sputum samples of NSCLC patients compared with controls. MiR-223, miR-31 and miR-1307 increased while miR-205, miR-15a and miR-194 decreased in tissue samples of NSCLC patients compared with controls. The best result of our research was belong to a panel of miR-15a, miR-100 and miR-194 with 93/3 sensitivity and 100 specificity with areas under the ROC curve at 0.97 in detection of NSCLC in sputum samples. Unlike mRNAs, miRNAs have prominent stability to endogenous and exogenous RNase activity, extreme temperatures and pH, long storage in frozen conditions, and repeated freeze-thaw cycles, besides that because of being powerful regulators of coding and non coding RNAs, miRNAs have been introduced as great biomarkers. Significant variable expression between cancer and control groups in noninvasive sputum samples could be a useful approach for detection of NSCLC. Key Words: NSCLC; Biomarker; miR-15a; miR-100 and miR-194
خط فهرستنویسی و خط اصلی شناسه
ba
عنوان اصلی به زبان دیگر
عنوان اصلي به زبان ديگر
Evaluation of changes in miRNA expression in tissue and sputum samples of Iranian patients with NSCLC
مقوله موضوعی
متن عنصر شناسه ای مقوله موضوعی
NSCLC
متن عنصر شناسه ای مقوله موضوعی
NSCLC
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )